定时＋程序运行时间问题

各位我用如下程序结构，计算流量，发现累积流量误差太大，主要原因是我一秒钟读就取脉冲数，而在主程序里不能保证每一秒都查询pulse_flag＝1，因为flow_act()这部分程序的运行时间有时大于一秒，所以就会漏掉脉冲数，所以累积流量就会出错。我现在不知道该怎么办？是优化
flow_act() 这部分程序（我看也不好优化了），还是提高主频（我现在是32.768K晶振）？？？各位能否指点一下？？？

中断1 //捕获中断捕获脉冲
中断2() //Timer_A定时一秒读取脉冲数
{
pulse_flag=1;
}

main（）
{
init（）；
while(1)
{ if(pulse_flag==1)
{
flow_act();//瞬时流量累积流量计算，涉及到乘除法
}
}


}

方法:提高主频或将TA定时时间拉长.

各位高手指点一下啊，我现在就是转不过弯儿，不知如何解决？我把Timer_A定时两秒，三秒后流量处理按一秒，这样还是有误差，好像这部分（flow_act();）程序运行时间不定，难道有时超过三秒？？？

提高主频？我现在手头只有32.768K的晶振，有办法提高吗？还是只有用8M晶振？

用FLL+提高MCLK

13X，14X没有锁频环，（FLL＋）啊