基因表达式编程（GEP）是一种基于基因组和表现型组的新型遗传算法。由于区域经济的投入与产出的映射关系的非线性、复杂性，本文基于GEP 算法对对我国各地区的经济产出进行了演化建模，选取人力资本、固定资产和耕地面积作为经济投入要素，并选取各地区经济数据中的2/3 作为训练样本，1/3 数据进行预测，结果表明用GEP 算法对经济产出建模得到的模型，除了对训练样本有较好的拟合精度之外，也具有较好的预测功能。