目前大部分的医学图像三维重建过程都是在PC机上完成的，由于PC机本身性能的限制和重建算法的复杂性，使得重建效率不高。针对这个问题，设计与实现了一个基于FPGA（Field Programmable Gate Array，现场可编程门阵列）的三维重建系统，系统中建立了一种基于FSL（Fast Simplex Link，快速单向链路）总线的体系结构，并对三维重建算法进行改进，使改进算法在新建立的体系结构中运行。实验表明，基于FPGA的三维重建系统利用重建算法在硬件中并行执行程序以及FSL总线的FIFO（First In First Out，先进先出）特性，对重建算法本身进行改进，克服了PC机三维重建系统中出现的耗时问题，很好地提升了三维重建的效率和实时性。