本文对基于脉动阵列结构的RSA公钥密码协处理器进行了深入的研究，通过对Montgomery模乘思想的深入分析，确定了免减基2算法作为模乘运算实现算法，同时系统的研究了脉动阵列结构这一专用处理器设计模型，结合器件特性设计出一种适于在FPGA上实现的模乘运算电路结构，通过引入流水线技术，实现了两次模乘运算并行处理。在此基础上，引入可变参数的设计理念，完成了可变参数模幂运算电路的设计与实现工作，有效的提高了算法硬件实现的灵活性。